13.12.2013 Новости, Идеи и практики автоматизацииТим Конрад: “Первые результаты весьма многообещающи: уже сегодня мы можем выявить первые признаки заболевания пятью формами рака”
Недавно компания SAP провела в Москве круглый стол, посвященный применению облаков и технологий Big Data, где в качестве примера были представлены результаты ее двухлетнего совместного проекта со Свободным университетом Берлина по ранней диагностике онкологических заболеваний, осуществляемой на программно-аппаратной in-memory-платформе SAP HANA. Доклад биоинформатика из указанного университета Тима Конрада вызвал двойственные чувства: с одной стороны — очень интересная и многообещающая методология, с другой — довольно сомнительное, на мой взгляд, отнесение ее к категории Big Data. В основе метода, который пока находится на стадии R&D, лежит масс-спектрометрический анализ крови, показывающий детальное распределение по массе белков в крови исследуемого пациента: интенсивность каждой линии масс-спектра пропорциональна концентрации данного вида молекул. Исследования показали, что спектрограммы людей, склонных к заболеванию той или иной формой рака, отличаются от спектрограмм людей здоровых. Собственно, для выявления этих отличий и нахождения значимых шаблонов и применяется SAP HANA. Задача осложняется зашумленностью результатов первичных измерений и необходимостью обрабатывать огромные массивы наблюдений с целью выявления статистически значимых закономерностей. Сопоставляя выделенные шаблоны с результатами клинических наблюдений, можно провести классификацию спектрограмм и отнести их к одному из трех “сигналов светофора” (вероятности последующего ...
читать далее.